Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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E2F4Q16254 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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E2F4Q16254 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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