Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms