Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAPSNQ13702 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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