Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms