Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms