Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms