Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPS1P31327 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPS1P31327 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPS1P31327 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CPS1P31327 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CPS1P31327 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CPS1P31327 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CPS1P31327 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms