Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2CP28335 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms