Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRAFP15056 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRAFP15056 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRAFP15056 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms