Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC166P0CW27 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms