Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMDSO60547 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms