Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRTO14522 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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