Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3443F7CCV5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3443F7CCV5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3443F7CCV5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3443F7CCV5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3443F7CCV5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3443F7CCV5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3443F7CCV5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3443F7CCV5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3443F7CCV5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms