Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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