Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms