Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms