Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms