Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms