Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms