Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms