Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sema3cQ62181 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sema3cQ62181 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sema3cQ62181 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sema3cQ62181 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sema3cQ62181 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sema3cQ62181 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sema3cQ62181 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sema3cQ62181 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Sema3cQ62181 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Sema3cQ62181 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms