Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms