Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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