Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms