Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms