Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA4P12838 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms