Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms