Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P01843 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01843 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01843 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01843 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms