Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms