Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm3880A0A1B0GSB3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm3880A0A1B0GSB3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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