Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top3bQ9Z321 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top3bQ9Z321 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms