Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms