Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sumo3Q9Z172 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms