Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms