Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,72■□□□□ 0,27
Psmb2Q9R1P3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16,72■□□□□ 0,27
Psmb2Q9R1P3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,72■□□□□ 0,27
Psmb2Q9R1P3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Psmb2Q9R1P3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Psmb2Q9R1P3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Psmb2Q9R1P3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16,7■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16,7■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,68■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,68■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,66■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16,66■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16,66■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Psmb2Q9R1P3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16,64■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,64■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16,64■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16,64■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,64■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,64■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,63■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16,63■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16,62■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16,62■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,62■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,62■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,61■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,61■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Psmb2Q9R1P3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,3 ms