Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cry2Q9R194 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cry2Q9R194 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cry2Q9R194 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cry2Q9R194 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms