Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr4a3Q9QZB6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nr4a3Q9QZB6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr4a3Q9QZB6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr4a3Q9QZB6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nr4a3Q9QZB6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nr4a3Q9QZB6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr4a3Q9QZB6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr4a3Q9QZB6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr4a3Q9QZB6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr4a3Q9QZB6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms