Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacl1Q9QXE0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hacl1Q9QXE0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hacl1Q9QXE0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacl1Q9QXE0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms