Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19,66■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19,66■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,65■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Reep6Q9JM62 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19,64■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19,64■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19,64■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,63■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19,63■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,63■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19,63■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,63■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,61■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,61■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19,61■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,61■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19,6■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,6■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19,6■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19,58■□□□□ 0,73
Reep6Q9JM62 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,58■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19,57■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19,56■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19,56■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,55■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,53■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19,52■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Reep6Q9JM62 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,4 ms