Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nova1Q9JKN6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nova1Q9JKN6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms