Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddx20Q9JJY4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx20Q9JJY4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ddx20Q9JJY4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms