Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC6

Rilpl1, RILP-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl1Q9JJC6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rilpl1Q9JJC6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rilpl1Q9JJC6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rilpl1Q9JJC6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rilpl1Q9JJC6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms