Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA7

Sphk2, Sphingosine kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk2Q9JIA7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sphk2Q9JIA7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sphk2Q9JIA7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sphk2Q9JIA7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sphk2Q9JIA7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms