Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syde1Q9DBZ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syde1Q9DBZ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms