Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot8Q9D8X5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot8Q9D8X5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot8Q9D8X5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot8Q9D8X5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot8Q9D8X5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot8Q9D8X5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot8Q9D8X5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot8Q9D8X5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnot8Q9D8X5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot8Q9D8X5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot8Q9D8X5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms