Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms