Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc130Q9D516 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc130Q9D516 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc130Q9D516 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms