Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ToporslQ9D2F8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ToporslQ9D2F8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ToporslQ9D2F8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms