Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tdrd12Q9CWU0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd12Q9CWU0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd12Q9CWU0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms