Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL2

Casz1, Zinc finger protein castor homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casz1Q9CWL2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Casz1Q9CWL2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Casz1Q9CWL2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Casz1Q9CWL2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casz1Q9CWL2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Casz1Q9CWL2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 814.8 ms